La redazione dei Piani è stata attuata in tre processi paralleli, coordinati e coerenti nelle tre Aree Marittime di riferimento (Adriatico, Ionio-Mediterraneo Centrale, Mediterraneo Occidentale) e si è realizzata in 6 Fasi, nella fattispecie:

Fase 1 – Stato iniziale e trend in atto ed attesi, che ha l’obiettivo di fornire una descrizione sintetica ma esaustiva del sistema ambientale, paesaggistico e degli usi dell’area marittima e dei principali trend in atto, finalizzata a supportare il processo di analisi e di pianificazione;

Fase 2 – Analisi di interazione fra usi e impatti sulle componenti ambientali, che affronta il tema dell’analisi delle interazioni reciproche fra usi del mare e fra usi del mare ed ecosistemi marini, allo scopo di rendere le attività fra loro compatibili ed ecologicamente sostenibili in un orizzonte di medio-lungo periodo;

Fase 3 – Visione e obiettivi strategici, che ha lo scopo di definire una visione e degli obiettivi strategici di indirizzo alla pianificazione, sia a scala nazionale che di Area Marittima;

Fase 4 – Pianificazione di livello strategico, che intende sviluppare la pianificazione di livello strategico sulle Aree Marittime e sue porzioni (Sub-Aree e Unità di Pianificazione), a partire dalla definizione delle visioni ed obiettivi specifici di Fase 3, fino all’indicazione di vocazioni, misure, raccomandazioni e indirizzi a scala locale;

Fase 5 – Metodologia ed indicatori per il monitoraggio e l’adattamento del Piano, che definisce le caratteristiche del Programma di Monitoraggio (PdM) con l’obiettivo di tenere traccia nello spazio e nel tempo dell’efficienza dell’implementazione dei Piani e di proporre eventuali misure migliorative nel caso in cui queste siano valutate necessarie, tramite adattamenti e revisioni di medio o di fine termine dei Piani;

Fase 6 – Attività per il consolidamento, l’attuazione e l’aggiornamento del Piano che mira a definire gli elementi di conoscenza rispetto alla tutela di specie, habitat ed ecosistemi che dovranno essere approfonditi, anche in relazione agli approfondimenti disciplinari necessari per colmare le incertezze o la mancanza di dati informazioni o conoscenze che verranno messi in evidenza per specifiche tematiche o per specifiche aree all’interno delle tre regioni.