La gestione degli ecosistemi costieri, come la Laguna, richiede una conoscenza dettagliata e aggiornata delle condizioni idrodinamiche e geomorfologiche, dei processi evolutivi in atto, naturali e/o indotti dalle attività antropiche, e non può quindi prescindere dalla conoscenza dei processi che accadono alle interfacce terra-laguna e laguna-mare, i cui effetti coinvolgono l’intero sistema lagunare.
Oggi, inoltre, l’esercizio del sistema MOSE implica numerosi potenziali impatti sulla circolazione idrodinamica lagunare, sulle caratteristiche fisico-chimiche dell’acqua all’interno della laguna, sui regimi mareali, sullo scambio di sedimenti mare-laguna, sui processi ecologici e morfologici lagunari, sui cicli vitali degli organismi lagunari e, nel suo insieme, sulle comunità e l’ecosistema lagunari.